Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
AtrQ9JKK8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms