Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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Mrpl39Q9JKF7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Mrpl39Q9JKF7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Mrpl39Q9JKF7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Mrpl39Q9JKF7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Mrpl39Q9JKF7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Mrpl39Q9JKF7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Mrpl39Q9JKF7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl39Q9JKF7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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