Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Ap4m1Q9JKC7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ap4m1Q9JKC7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms