Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uchl3Q9JKB1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms