Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms