Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ4

Ube2j1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2j1Q9JJZ4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2j1Q9JJZ4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms