Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx20Q9JJY4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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