Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd3Q9JJY3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms