Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Gfra4Q9JJT2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Gfra4Q9JJT2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Gfra4Q9JJT2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Gfra4Q9JJT2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gfra4Q9JJT2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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