Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Efcc1Q9JJF6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Efcc1Q9JJF6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Efcc1Q9JJF6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Efcc1Q9JJF6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Efcc1Q9JJF6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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