Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc86Q9JJ89 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms