Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms