Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS5

Sv2a, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2aQ9JIS5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sv2aQ9JIS5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms