Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms