Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms