Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SelenofQ9ERR7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms