Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb2Q9ERK7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms