Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms