Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco1c1Q9ERB5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco1c1Q9ERB5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco1c1Q9ERB5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco1c1Q9ERB5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco1c1Q9ERB5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco1c1Q9ERB5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco1c1Q9ERB5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco1c1Q9ERB5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco1c1Q9ERB5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco1c1Q9ERB5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slco1c1Q9ERB5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms