Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhojQ9ER71 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhojQ9ER71 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhojQ9ER71 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhojQ9ER71 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhojQ9ER71 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhojQ9ER71 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhojQ9ER71 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhojQ9ER71 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhojQ9ER71 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms