Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER05

Ctrl, Chymopasin, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtrlQ9ER05 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CtrlQ9ER05 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms