Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms