Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK8

Trpv4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv4Q9EPK8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpv4Q9EPK8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms