Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufs3Q9DCT2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufs3Q9DCT2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufs3Q9DCT2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufs3Q9DCT2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufs3Q9DCT2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufs3Q9DCT2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufs3Q9DCT2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufs3Q9DCT2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufs3Q9DCT2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufs3Q9DCT2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufs3Q9DCT2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufs3Q9DCT2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndufs3Q9DCT2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndufs3Q9DCT2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndufs3Q9DCT2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndufs3Q9DCT2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndufs3Q9DCT2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufs3Q9DCT2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms