Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan4Q9DCK3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Tspan4Q9DCK3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Tspan4Q9DCK3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Tspan4Q9DCK3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Tspan4Q9DCK3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Tspan4Q9DCK3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Tspan4Q9DCK3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Tspan4Q9DCK3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Tspan4Q9DCK3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Tspan4Q9DCK3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Tspan4Q9DCK3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Tspan4Q9DCK3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Tspan4Q9DCK3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Tspan4Q9DCK3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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