Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC50

Crot, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrotQ9DC50 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CrotQ9DC50 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms