Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Hmg20aQ9DC33 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Hmg20aQ9DC33 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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