Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms