Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

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Length 606 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tm9sf1Q9DBU0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tm9sf1Q9DBU0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tm9sf1Q9DBU0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tm9sf1Q9DBU0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms