Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Smg9Q9DB90 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
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Smg9Q9DB90 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Smg9Q9DB90 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
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Smg9Q9DB90 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms