Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pop5Q9DB28 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms