Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf4Q9DAW6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms