Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms