Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms