Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Usp12Q9D9M2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Usp12Q9D9M2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Usp12Q9D9M2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Usp12Q9D9M2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Usp12Q9D9M2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Usp12Q9D9M2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Usp12Q9D9M2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Usp12Q9D9M2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Usp12Q9D9M2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Usp12Q9D9M2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms