Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J8

Bpifa3, BPI fold-containing family A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifa3Q9D9J8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bpifa3Q9D9J8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms