Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V0

Hm13, Minor histocompatibility antigen H13, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hm13Q9D8V0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hm13Q9D8V0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hm13Q9D8V0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hm13Q9D8V0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms