Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U0

Ifrd2, Interferon-related developmental regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd2Q9D8U0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd2Q9D8U0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd2Q9D8U0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd2Q9D8U0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd2Q9D8U0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd2Q9D8U0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd2Q9D8U0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd2Q9D8U0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd2Q9D8U0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd2Q9D8U0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd2Q9D8U0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd2Q9D8U0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd2Q9D8U0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd2Q9D8U0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd2Q9D8U0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd2Q9D8U0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd2Q9D8U0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd2Q9D8U0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifrd2Q9D8U0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifrd2Q9D8U0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifrd2Q9D8U0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifrd2Q9D8U0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifrd2Q9D8U0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifrd2Q9D8U0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifrd2Q9D8U0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifrd2Q9D8U0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifrd2Q9D8U0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifrd2Q9D8U0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifrd2Q9D8U0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifrd2Q9D8U0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifrd2Q9D8U0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifrd2Q9D8U0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifrd2Q9D8U0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifrd2Q9D8U0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifrd2Q9D8U0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms