Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Tvp23bQ9D8T4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tvp23bQ9D8T4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tvp23bQ9D8T4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tvp23bQ9D8T4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tvp23bQ9D8T4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tvp23bQ9D8T4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tvp23bQ9D8T4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tvp23bQ9D8T4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tvp23bQ9D8T4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tvp23bQ9D8T4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tvp23bQ9D8T4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tvp23bQ9D8T4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tvp23bQ9D8T4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tvp23bQ9D8T4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tvp23bQ9D8T4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tvp23bQ9D8T4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tvp23bQ9D8T4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tvp23bQ9D8T4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tvp23bQ9D8T4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tvp23bQ9D8T4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tvp23bQ9D8T4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tvp23bQ9D8T4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tvp23bQ9D8T4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tvp23bQ9D8T4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tvp23bQ9D8T4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tvp23bQ9D8T4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tvp23bQ9D8T4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tvp23bQ9D8T4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tvp23bQ9D8T4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms