Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms