Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Derl3Q9D8K3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Derl3Q9D8K3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms