Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms