Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fip1l1Q9D824 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms