Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d4aQ9D7V1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms