Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Cldn22Q9D7U6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Cldn22Q9D7U6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Cldn22Q9D7U6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Cldn22Q9D7U6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Cldn22Q9D7U6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cldn22Q9D7U6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cldn22Q9D7U6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cldn22Q9D7U6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cldn22Q9D7U6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Cldn22Q9D7U6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Cldn22Q9D7U6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Cldn22Q9D7U6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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