Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms