Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms