Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms