Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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Rab11fip1Q9D620 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Rab11fip1Q9D620 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Rab11fip1Q9D620 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Rab11fip1Q9D620 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Rab11fip1Q9D620 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Rab11fip1Q9D620 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Rab11fip1Q9D620 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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Rab11fip1Q9D620 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Rab11fip1Q9D620 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Rab11fip1Q9D620 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Rab11fip1Q9D620 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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