Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms